Добрый день. Вы в курсе, что семейная ипотека предполагает приобретение жилого дома, который продаётся юридическим лицом?
Если продавец физическое лицо, то необходимо рассматривать другую программу кредитования (другая ставка и условия). При обычной ипотеке можно маткапитал использовать как первоначальный взнос, а также модно использовать субсидию.

По семейной ипотеке продавец должен быть юридическим лицом. От физлица - только по уступке.

В схеме, когда маткапитал именно -ПЕРВОНАЧАЛЬНЫЙ взнос, посоветую: уточните в банке (для Вашего понимания) как это происходит. Если схематично:
1. подписание договора купли-продажи
2. отправили на регистрацию перехода права.
3. ПОСЛЕ того, как переход права зарегистрирован, об этом сообщается в Пенсионный фонд и оформляется пересылка средств маткапитала на счёт Продавца. Иногда , особенно, если маткапитал из другого дальнего региона, поступления денег ждать долго.
4. Только когда деньги маткапитала на счёт продавца придут, считается, что первоначальный взнос есть, и только тогда Банк рассматривает выдачу ипотечных денег Покупателю. и далее перечисление их продавцу.
Если в исполнении пункта 3 промедление ( неизвестно на какое время), Продавец с практически почти проданным домом абсолютно без денег.
ЕСЛИ я бываю со стороны Продавца, могу сказать свои наблюдения:
после вникания в эту схему, практически все продавцы, с какими общалась,
решают ждать другого покупателя , у которого ПЕРВОНАЧАЛЬНЫЙ взнос на ипотеку есть деньгами своими.
А уж ПОТОМ ( Продавца это уже не будет касаться), банку ипотечник как пусть как хочет гасит, хоть маткапиталом, хоть субсидиями разнообразными.

У некоторых банков есть ипотечные программы покупки жилья у первого участника долевого строительства - физлица, т.е. покупка по первой переуступке.
Причем, это и крупные банки тоже. Тот же зеленый.
А в целом здорово, что еще есть возможность в стране приобрести жилье условно говоря бесплатно исключительно за счет гос поддержки.